Коварная королева Кризалис снова позарилась на благополучие жителей Понивилля, благо, что в городке живут смельчаки, которые не боятся дать ей отпор. Однако в состав команды входит не так много участников, поэтому игра Пони и стражи Гармонии предлагает вступить в бой вместе героями. Значительная часть территорий уже находится под властью захватчиков, поэтому первым делом следует начать освобождение Вечнозеленого леса и Призрачного ущелья.
Контролировать действия вснх храбрецов, физически невозможно, поэтому выберите наиболее понравившегося персонажа и начинайте выполнять миссии. На локациях пони – стражи гармонии ожидает много опасностей, но и приятные сюрпризы здесь тоже имеются, так что старайтесь не пропускать предметы, обеспечивающие покупку улучшений.